Het interne toezicht van SIOZ wordt gevormd door de Raad van Toezicht. De Raad van Toezicht is een onafhankelijk orgaan dat het belang van de stichting in acht neemt. De Raad toetst het bestuurlijk handelen, de maatschappelijke doelstellingen en het eigen functioneren. De Raad van Toezicht doet dat op basis van het Reglement van de Raad en op basis van het toetsingskader van de Code Goed Bestuur die de leden van de PO-Raad gezamenlijk hebben vastgesteld.
Het College van Bestuur van SIOZ legt op hoofdlijnen verantwoording af aan de Raad van Toezicht. Daarnaast is de Raad van Toezicht de werkgever van de bestuurder en strategisch adviseur van het College van Bestuur. Verder is een aantal besluiten van het College van Bestuur onderworpen aan de goedkeuring door de Raad van Toezicht, zoals de begroting en de jaarrekening.
